分析测试中心是石河子大学大型仪器设备共享平台的重要组成部分。是促进大学仪器设备的合理配置，实现大型仪器共享使用，提高仪器使用效益的基础平台；是为我校“双一流学科”建设和兵团经济社会发展提供优质服务的专业平台；是为创建高水平大学而搭建的一个结合高端科研、教学、社会服务为一体的重要平台。通过211三期和“一省一校工程”项目的投入，石河子大学分析测试中心已拥有透射电子显微镜、扫描电子显微镜、气相色谱-稳定同位素比质谱、电感耦合等离子体质谱、超高效液相色谱-三重四级杆质谱联用仪、高效液相色谱、气相色谱、氨基酸分析仪、动态热机械分析仪、红外-拉曼光谱、双微焦斑单晶衍射仪等仪器设备。实验室面积约3000m²，设有光谱室、质谱室、色谱室、表面形态室、核磁共振室、转基因安全检测室、农产品质量检测室、感官检测室共八个检测室，可开展成分分析、微区分析、结构鉴定、性能分析、药品分析、食品分析、环境分析、生物大分子互作等相关项目检测及研究，可开展部分仪器操作培训，服务可面向化学、材料、生物、农学、医学、环境、药品和食品等多学科。